ニ年八ヵ月の死闘により遂に、第ニ次人型戦役は終着した。人では在らざる彼女達は英雄と崇められ「人形神（ヒトガミ）」と呼ばれた。人類は遂に平和を手に入れたのであった。 彼女達の幸せも続くかと思われた… 人類は愚かな生き物であった。 時が立ち、戦乱を知らない世代の子達は彼女達を疎ましく思ったり、恐怖すらする者達も居た。 戦争の無くなった世界では彼女達が異形と畏怖される対象となってしまった。 彼女達は悲しみ傷ついた。 あるものは眠りにつき、あるものは旅にでた、またあるものは… 彼女達は時代から姿を消した。 そして、時が流れ…HG2348年 ゴミ山に住む少年がある人形（ヒトガタ）と出会う、 「…ダレ？ワタシの名前を呼ぶのは」 再び、人形たちの心システムは動き出そうとしていた…